Alors que les épisodes de fortes chaleurs se multiplient, l'Agence régionale de santé (ARS) Bourgogne-Franche-Comté appelle les habitants à profiter des baignades en toute sécurité. Les contrôles sanitaires réalisés en 2025 montrent une qualité de l'eau globalement très satisfaisante dans la région, où la très grande majorité des sites sont classés en bonne ou excellente qualité.
Une grande majorité de sites de bonne qualité
En 2025, 77 sites de baignade naturelle ont été contrôlés en Bourgogne-Franche-Comté. Les résultats sont encourageants :
Pour la saison estivale 2026, 78 sites de baignade naturelle sont recensés dans la région. Six ne seront toutefois pas ouverts au public, notamment en raison de travaux, de difficultés d'organisation ou d'un classement insuffisant durant plusieurs années.
Une carte dominée par les sites d'excellente qualité
La carte publiée par l'ARS confirme cette bonne situation. Dans le Doubs, les principaux sites, notamment Malbuisson, Montperreux, Oye-et-Pallet, Saint-Point-Lac, Les Grangettes, Labergement-Sainte-Marie ou encore Osselle-Routelle, sont classés en qualité excellente.
Dans le Jura, les baignades de Clairvaux-les-Lacs, Doucier, Fontenu, La Tour-du-Meix, Orgelet, Maisod, Les Rousses ou Lamoura affichent également une excellente qualité des eaux.
En Haute-Saône, la plupart des sites sont classés excellents, à l'exception d'Autet, classé en bonne qualité, et de Chassey-lès-Montbozon, qui obtient un classement suffisant.
Dans le Territoire de Belfort, les sites de Champagney, Sermamagny et Brognard sont également classés en qualité excellente.
Il est néanmoins quelques sites fermés ainsi que plusieurs plans d'eau faisant l'objet d'une surveillance renforcée des cyanobactéries, comme à Pont-de-Roide-Vermondans (25) et Parcey (39).

Une surveillance tout au long de l'été
L'ARS effectue des prélèvements microbiologiques avant l'ouverture des sites puis tout au long de la saison. Des analyses complémentaires sont réalisées sur les secteurs sensibles aux cyanobactéries. En cas de dégradation de la qualité de l'eau, une fermeture temporaire peut être décidée afin de protéger les baigneurs. Les résultats sont consultables directement sur les lieux de baignade, en mairie ainsi que sur le site officiel du ministère chargé de la Santé.
Prudence face aux noyades et à la chaleur
L'ARS rappelle que les fortes chaleurs favorisent également les noyades. En France, 1 418 noyades accidentelles, dont 409 mortelles, ont été recensées durant l'été 2025. Les autorités recommandent de privilégier les zones surveillées, de ne jamais laisser les enfants sans surveillance, d'entrer progressivement dans l'eau, d'éviter la baignade après un repas copieux ou une consommation d'alcool et de bien s'hydrater.
Enfin, les plages sont désormais des espaces sans tabac pendant la saison balnéaire. L'ARS invite également chacun à préserver ces espaces naturels en respectant les consignes de propreté et à rester vigilant face au risque, rare mais réel, de leptospirose après une baignade en eau douce.
Alors que l'été 2025 s'installe, les plaisirs de la baignade attirent de nombreux vacanciers dans les plans d’eau naturels de la Bourgogne-Franche-Comté. Pour éviter tout désagrément, l’ARS rappelle l’importance de choisir des zones de baignade surveillées, soumises à un contrôle sanitaire strict.
Une surveillance renforcée pour protéger la santé des baigneurs
Chaque année, pendant la saison estivale, l’ARS Bourgogne-Franche-Comté assure une surveillance sanitaire rigoureuse de l’ensemble des sites de baignade de la région. Ce dispositif comprend :
Certaines zones, identifiées comme sensibles à la prolifération de cyanobactéries, font également l’objet de recherches spécifiques. Ces micro-algues peuvent provoquer des irritations, vomissements ou troubles digestifs en cas de contact ou d’ingestion. En cas de résultats inquiétants, l’ARS peut demander la fermeture immédiate d’un site et en informer le public. La sécurité prime.
Une eau majoritairement de bonne qualité
Le classement établi en 2024 sur la base des analyses de 2021 à 2024 révèle une tendance globalement très positive. Soit plus de 87 % des sites classés en excellente ou bonne qualité :52 sites affichent une qualité excellente. 10 sites ont une bonne qualité. 4 sites présentent une qualité suffisante. Un site est jugé de qualité insuffisante. 4 sites ne sont pas classés, soit par manque de prélèvements, soit en raison de leur nouveauté
52 sites classés « excellente qualité » en Bourgogne France-Comté
D’après les analyses réalisées entre 2021 et 2024, les sites suivants ont obtenu le meilleur classement sanitaire européen dans le Doubs et le Jura. Ces zones vous garantissent une eau propre, saine et contrôlée tout au long de l’été.
Département du Doubs (25) :
Département du Jura (39) :

Dans le Doubs : l’Étang des Prés à Chaux, lanterne rouge de la région
C’est un triste record pour l’Étang des Prés, niché à Chaux, à proximité du Territoire de Belfort. Ce site est le seul de toute la région à avoir été classé en « qualité insuffisante » pour la saison estivale 2025. Un classement peu enviable, fruit de plusieurs épisodes de pollution récurrents et d’une concentration bactérienne dépassant les seuils recommandés. Par mesure de précaution, la baignade y est formellement déconseillée, et le site fait l’objet d’un suivi renforcé par l’Agence Régionale de Santé.
Bonne nouvelle cependant : aucun autre site du Doubs ne figure parmi les zones non classées. À noter néanmoins, que le Lac de Saint-Point à Oye-et-Pallet, bien que classé en qualité excellente, fait l’objet d’une surveillance spécifique pour les cyanobactéries. Ce plan d’eau très prisé en été réunit les conditions idéales à leur développement : eaux stagnantes, température élevée, forte fréquentation. Rien d’inquiétant pour l’instant, mais une vigilance permanente s’impose.
Dans le Jura : vigilance autour du lac de Vouglans
Dans le Jura, deux sites du lac de Vouglans — vaste étendue d’eau turquoise qui serpente entre les montagnes — affichent une qualité seulement « suffisante » :
Ces deux zones, parmi les plus fréquentées du département, connaissent ponctuellement des dépassements bactériens, notamment après des épisodes pluvieux ou lors d’une trop forte affluence. Si la baignade y reste autorisée, elle est à pratiquer avec prudence. L’ARS y maintient une veille sanitaire étroite. Par ailleurs, les lacs d’Ilay, de Bonlieu et de Narlay, véritables joyaux naturels jurassiens, font l’objet d’une surveillance environnementale pour risque de cyanobactéries. Ces micro-algues, invisibles à l’œil nu, peuvent libérer des toxines irritantes ou digestives en cas d’exposition prolongée.
Pour de plus amples informations ! https://baignades.sante.gouv.fr/baignades/editorial/fr/accueil.html