Ludovic Fagaut a conservé son avantage du 1er tour en terre bisontine. Il recueille 53,2% des suffrages. Anne Vignot, la maire sortante de Besançon arrive en deuxième position, avec 46,7% des suffrages. Depuis 1953, la gauche était à la tête de la ville. Ludovic Fagaut disposera de 42 sièges au sein du nouveau conseil municipal. La minorité disposera de 13 sièges dont trois élus insoumis.