Dans un communiqué de presse, Europe Ecologie Les Verts dénonce le positionnement de la Région Bourgogne Franche-Comté et de son vice-président aux transports, Michel Neugnot, qui souhaitent se désengager de la ligne Neuchâtel-Travers-Pontarlier-Frasne. Les Verts jugent ce choix politique incompréhensible « dans un contexte de réchauffement climatique ». Il est précisé que les élus seront « très vigilants quant à la position définitive de la Région » et qu’ils sauront se mobiliser « autant que nécessaire aux côtés des associations pour défendre l’offre ferroviaire ».